Inger forsker i byens skjulte dyreliv: Selvom vi ikke kan se det, vrimler det med flagermus

Fra Rundetårn, Rådhustårnet, Strøget, en skolegård og en altan lytter biolog Inger Kærgaard efter flagermus med en ultralydsdetektor, en såkaldt flagermuslytteboks. Ingen ved med sikkerhed, hvor de små, flyvende pattedyr holder til om dagen, og det vil Inger finde ud af. Flagermusene er vigtige, fordi de giver et fingerpeg om, hvordan det står til med byens biodiversitet.